Caro Michel seja bem vindo. Vou postar novamente os links que já inseri neste tópico.
http://www.somarmeteorologia.com.br/security/defesa_civil/clima3.php
Este relatório é claro: haverá El NINo de baixa ou moderada intensidade, mas ele por si só não garante seca prolongada ou chuvas. O sistema de chuvas amazonico é mais complexo: http://www.oecoamazonia.com/br/artigos/9-artigos/128-a-seca-de-2010-na-amazonia
El NINO em via de regra provoca seca na região norte (Rio Negro), contudo isso não implica necessariamente numa forte vazante pois depende dos níveis dos rios da região sul. Estes por sinal, sofrem com a atuação das águas do atlantico norte, mas não com El NINO.
Em 2010, última grande estiagem, houve um El NINO fraco, mas com aumento da temperatura do atlantico norte.
Então conclui-se (basta ler nos estudos), que o EL NINO não é por si só determinante para alterar todo o regime de águas. Se houver aquecimento das águas do atlantico de forma acentuada, os rios do sul secam e aí abre o ralo do Rio Negro.